PCR检测法检测到该变种?关于新冠变异毒株Omicron,你需要知道这些
Omicron这一变种病毒首先在非洲博茨瓦纳发现,研究发现其含有的刺突蛋白内含有35个突变。刺突蛋白的突变会影响病毒感染细胞和传播的能力,但也会使免疫细胞更难攻击病原体。香港大学公共卫生学院教授潘烈文昨日表示,中和抗体能够辨认出新变异病毒株某些突变的地方,但不能完全识别,「若病毒变异,我们接种疫苗产生出来的中和病毒抗体,未必能完全辨认病毒株,令抗体效用减低,甚至疫苗效用会降低」。
全球首张Omicron毒株图与Delta刺突蛋白突变对比图(图源意大利罗马科研团队)
新毒株突变令人担忧,PCR检测持续检测到该变种
关于Omicron这一毒株最早的官方报道,来自2021年11月24日,世界卫生组织于这一天首次收到最新在南非被发现的B.1.1.529变异株的报告。南非流行病学情况的特点是报告病例中出现三个不同峰值时期,其中最近的一个主要是德尔塔变异株。最近几周南非的新冠感染率再次急剧上升,与检测到B.1.1.529这一变异毒株的时间吻合。首个被证实感染该变异株的样本采集时间是11月9日。
新型冠状病毒进化技术咨询小组(SARS-CoV-2 Virus Evolution(TGA-VE))是一个独立的专家组,主要职责有定期监测和评估新型冠状病毒的进化情况,并评定新冠病毒的特定突变以及突变组合是否会改变新冠病毒行为。2021年11月26日,新型冠状病毒进化技术咨询小组被世卫组织召集评估新型冠状病毒变异株:B.1.1.529,也就是Omicron。
这一变异毒株有大量突变,其中一些突变令人担忧。初步证据显示,与之前其他“值得关切”的新冠毒株(VOC)相比,Omicron毒株可能导致人们二次感染新冠的风险增加。几乎在南非所有省份,感染Omicron变异株的病例报告数量似乎都在增加。现有的新型冠状病毒PCR诊断法(SARS-CoV-2 PCR diagnostics)持续检测出Omicron。数个实验室已经发表声明,一种被广泛使用的PCR检测未检测到三个靶基因中的其中一个基因(称作S基因缺失或S基因靶标失败),因此该检测可以用作标记该变异毒株,等待测序确认。通过使用这种方法,该变异毒株被检测出的速度比以往造成感染激增的其他变异毒株都快,表明这一最新变异毒株可能具有生长优势。
许多关于最新变异毒株的研究正在进行,新型冠状病毒进化技术咨询小组也将继续评估最新变异毒株。世界卫生组织将会及时向成员国和大众公布最新研究成果。
针对Omicron,世卫组织要求各国这样做
针对这一快速变异的新毒株,世卫组织要求各国采取如下行动:
1. 加强监测和测序工作,更好地了解传播中的SARS-CoV-2变异。
2. 将完整的基因组序列和相关元数据提交到一个公开的数据库,如GISAID。
3.通过《国际卫生条例》机制向世卫组织报告与值得关切的变异毒株(VOC)有关的初始病例/集群。
4. 在能力范围内,与国际社会协调,进行实地调查和实验室评估,对新冠病毒疾病进行流行病学调查和实验室评估,以提高值得关切的变异毒株对新冠流行病学的严重程度、公共卫生和社会措施有效性、诊断方法、免疫应答、抗体中和或其他相关特征的潜在影响的理解。
世卫组织同时提醒民众们注意,请采取措施来减少新冠病毒疾病的风险,包括采取经过验证的公共卫生和社会防护措施,如戴上合适的口罩、保持手部卫生、与其他人保持物理距离、改善室内空间通风、避免出现在拥挤的空间和接种疫苗。
全球各国对Omicron的反应
南非约翰内斯堡机场
南非科学家在确认该变种病毒后,大感震惊,发现该变种病毒为导致本月初以来南非单日确诊病例增加10倍的罪魁祸首。据悉,本月初南非单日有106宗确诊,但在24日已达1200宗。南非卫生部长法拉表示,新变种病毒必须严重关注,该病毒是使病例急剧增加的原因,构成一大威胁。
英国卫生安全局于25日表示,Omicron含有一种新的刺突蛋白,与作为研发疫苗基础的那种不同,现有的疫苗可能无效,故有专家形容它是「迄今最恶劣的变种病毒」。英国卫生安全局又指出,由于该变种病毒存在多个突变,或会避开曾经感染或疫苗产生的免疫反应,亦有可能增加传播力。
世卫COVID-19技术主管范科霍芙(Maria Van Kerkhove)在远程记者会上亦表示,变种病毒的多种突变,可能对病毒行为产生影响,世卫将会用几周时间,研究新变种病毒对疫苗的影响。
巴黎巴斯德研究所的专家文森·埃努夫(Vincent Enouf)告诉法新社:"从基因上来看,这确实是一种非常特别的变种,令人担忧。“但他认为,"我们必须保持理性,继续监测,不要完全让民众担惊受怕。我们需要检查我们目前的疫苗所产生的抗体是否仍在起作用,在什么水平上起作用,以及这是否仍能防止严重的病例。这些都需要以实验室的测试和有关国家的真实数据为基础的。“
美国病毒学家安吉拉-拉斯穆森(Angela Rasmussen)在推特上补充说,包括她自己在内的病毒学家都很担心。但她认为任何人都不能仅仅根据目前掌握的数据就断定之前的努力都白费。
美国辉瑞公司的合作伙伴德国实验室BioNTech的一位女发言人告诉法新社,最新发现的变异株Omicron与此前的变体有显著的不同,该实验室预计 "最迟在两周内 "获得初步研究结果。
科学家们坚持认为,在任何情况下,疫苗接种仍然是至关重要的。
普瑞君说:更强的变种出现,也就意味着各国监管部门对抗原检测产品的审核注册要求会有所变化,预计又会增加除Delta以外的Omicron要求。持续改进抗原产品对新变异病毒的检测性能,是市场玩家之间的一场技术竞赛。如有变异株测试需求,欢迎来询普瑞君!
Source:WHO官网,部分图文源自网络
点击阅读原文,查看WHO原文报道
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