专家解读 | 新的COVID-19测试方法有可能在接触后几小时内捕获感染者
近日,Flatiron研究所计算生物学中心(CCB)的研究人员公布了正在开发一种处于早期阶段的新的分子测试方法,该方法可以在受检人员接触COVID-19病毒几小时后就能识别出是否被感染,其准确度近乎完美,耗时上比目前的检测方法要更短。
据CCB的研究员、该研究的主要作者Frank Zhang说,目前的COVID-19测试依赖于相同的原理——需要在呼吸道等区域积累了病毒物质。但受检者处于感染早期,尚未积累大量的病毒物质,进而无症状时,这就对病毒检测形成了挑战。
CCB团队开发的新方法不是检测病毒物质本身,而是将目标对准了感染SARS-CoV-2后身体进行免疫反应的标志物。他们注意到,当病毒开始对身体攻击时,特定的基因打开,这些基因的片段产生mRNA,能够为构建特定的蛋白质提供信号。通过了解这种特定的混合mRNA分子如何帮助编码蛋白质来对抗病毒的机制,该团队能够根据这些mRNA分子的相对丰度来发现身体正在进行免疫反应的信号。据研究人员称,这是第一次采用这种方法来诊断传染病。
为了实现和验证这种新的检测方法,CCB团队使用了2020年美国海军陆战队新兵研究的血液样本,这些样本是在新兵感染COVID-19前、后收集的。根据研究人员的研究,从这些样本发现了1000多个与疾病相关的mRNA-变异比例变化。当研究人员将这种方法用于现实世界的血液样本时,它被证明在检测SARS-CoV-2感染方面有98.4%的准确率(甚至在无症状的人中也是如此)。相较于抗原检测已被证明只有大约60.5%的准确性,这是对抗原测试的明显改进。
现在在雪松-西奈医学中心任教的张教授指出,令人惊讶的是他们的测试效果如此之好,它显示了作为金标准PCR测试的补充测试方法的前景。但仍有工作要做,他说,在这项初步研究中,该团队只测试了血液样本,而不是现有测试中使用的更常见、更容易收集的鼻拭子。此外,该团队指出,虽然RNA剪接计算框架为感染的宿主反应诊断提供了一条有希望的途径,但它需要进行进一步的工作以确保他们能够区分身体对SARS-CoV-2的反应和其他病毒引起的感染。基于其他团队在创建测试方面(识别哪些基因在感染期开启)取得了进展,新方法是具有兼容性的,张教授认为二者是存在联合探索的可能性的。
专家观点
王永强博士
普瑞纯证首席科学家
全球临床总监
北美华人临床化学家协会(NACCCA)会长 2020-2021
对宿主的免疫反应生物标志物进行检测比基于病原体本身的测定可能更早些发现疾病。然而,在RNA替代剪接 (AS,Alternative Splicing)的作用和用途仍然存在未知的情况下,该团队以SARS-CoV2为案例研究,计算数据显示出AS生物标志物提高了对新型冠状病毒肺炎 (COVID-19) 包括无症状感染者诊断的准确性。这不可不说是很前卫的。推而广之,这大大有助于进一步探索其他传染病中基于宿主的AS生物标志物的发掘,为生物标志物的研究设计和未来开发前景提供了新的路径和一束亮光。然而,作为临床应用的诊断工具和产品,还有相当长的一段路要走,譬如简化前端样品处理,选择更简便的分析测试方法,拿出可靠的重复性准确性参数指标和需要进行多中心临床试验评估验证等等,并且免疫反应生物标志物对疾病诊断的特异性还有待讨论和进一步验证。
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